「いちどでいいから、人魚に会ってみたいなァ…」。 人魚の存在(そんざい)を信じるのび太は、「人魚なんて、この世にいるわけがない」というスネ夫と“討論会（とうろんかい）”を開いて対決！ だが、スネ夫だけでなく、しずかにまで「人魚は、あくまで人間が作り上げた伝説よ」と言われてしまい、ガックリ…。 それでもあきらめきれないのび太は、ドラえもんに人魚の存在をたしかめてほしいとたのみこむ。 そこで、ドラえもんが取りだしたのは、宇宙のありとあらゆる情報がつまっている『宇宙完全大百科と端末(たんまつ)機』。 その大百科の中から人魚にかんする情報をさがしたところ、なんと人魚の姿を写し取った“魚拓(ぎょたく)”が出てきたのだ！ おどろいたのび太とドラえもんは「人魚に会えるかもしれない！」と大コーフン！ 魚拓をとった青年・ヨハンに会いに行くため、100年前にタイムスリップするが…!?